Rodopsinas bacterianas

Estruturas proteicas dispoñibles:
Pfam	estruturas / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	resumo de estruturas
PDB	1e12A:29-271 1vgoB:19-253 1s52B:22-244 1r84A:22-245 1r2nA:22-255 1bac :22-238 1q5iA:22-255 1iw6A:22-255 1py6A:22-255 1tn0B:22-255 1s53A:22-244 1bm1 :22-240 1e0pB:22-245 1qkpA:22-255 1x0k1:22-255 1c8rA:22-244 1qkoA:22-255 1brx :22-241 1kg9A:22-244 1vjmA:22-255 2at9 :22-240 1kgbA:22-244 1p8iA:22-255 1x0i1:22-255 1jgjA:4-217 1ap9 :22-238 1kmeB:22-244 1pxsA:22-255 1p8uA:22-255 1brrA:22-253 1c3wA:22-244 1jv6A:22-255 1ucqA:22-255 1x0sA:22-255 1tn5A:22-255 1cwqB:22-253 1p8hA:22-255 1s54A:22-244 1o0aA:22-255 1pxrA:22-255 1f50A:22-244 1q5jB:22-255 1jv7A:22-255 1s51B:22-244 1dzeA:22-255 2brd :22-241 1m0mA:22-255 1iw9A:22-255 1c8sA:22-235 1mgyA:22-255 1fbbA:22-255 1ixfA:22-255 1m0kA:22-255 1fbkA:22-255 1m0lA:22-255 1s8lA:22-255 1bct :176-244 1qhjA:22-245 1kg8A:22-244 1bad :22-238 1bhb :22-83 1bha :22-83 1xjiA:22-255 1l0mA:22-231 1qm8A:22-255 1s8jA:22-255 1f4zA:22-244 1gueA:4-231 1gu8A:4-231 1h2sA:4-225 1xioA:4-233 1sr1 :4-214

Rodopsinas bacterianas
	Trímero de bacteriorrodopsina
Identificadores
Símbolo	Bac_rhodopsin
Pfam	PF01036
InterPro	IPR001425
PROSITE	PDOC00291
SCOPe	2brd / SUPFAM
TCDB	3.E.1
OPM superfamily	6
OPM protein	1vgo
Pfam
Estruturas proteicas dispoñibles:
Pfam	estruturas / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	resumo de estruturas
PDB	1e12A:29-271 1vgoB:19-253 1s52B:22-244 1r84A:22-245 1r2nA:22-255 1bac :22-238 1q5iA:22-255 1iw6A:22-255 1py6A:22-255 1tn0B:22-255 1s53A:22-244 1bm1 :22-240 1e0pB:22-245 1qkpA:22-255 1x0k1:22-255 1c8rA:22-244 1qkoA:22-255 1brx :22-241 1kg9A:22-244 1vjmA:22-255 2at9 :22-240 1kgbA:22-244 1p8iA:22-255 1x0i1:22-255 1jgjA:4-217 1ap9 :22-238 1kmeB:22-244 1pxsA:22-255 1p8uA:22-255 1brrA:22-253 1c3wA:22-244 1jv6A:22-255 1ucqA:22-255 1x0sA:22-255 1tn5A:22-255 1cwqB:22-253 1p8hA:22-255 1s54A:22-244 1o0aA:22-255 1pxrA:22-255 1f50A:22-244 1q5jB:22-255 1jv7A:22-255 1s51B:22-244 1dzeA:22-255 2brd :22-241 1m0mA:22-255 1iw9A:22-255 1c8sA:22-235 1mgyA:22-255 1fbbA:22-255 1ixfA:22-255 1m0kA:22-255 1fbkA:22-255 1m0lA:22-255 1s8lA:22-255 1bct :176-244 1qhjA:22-245 1kg8A:22-244 1bad :22-238 1bhb :22-83 1bha :22-83 1xjiA:22-255 1l0mA:22-231 1qm8A:22-255 1s8jA:22-255 1f4zA:22-244 1gueA:4-231 1gu8A:4-231 1h2sA:4-225 1xioA:4-233 1sr1 :4-214

As rodopsinas bacterianas son unha familia proteica de opsinas procarióticas. Son proteínas de tipo retinilideno (que se unen ao retinal), que realizan un transporte de ións dependente da luz e funcións sensoriais nun grupo de arqueas halófilas, as halobacterias^[1]^[2] e outros procariotas. Son proteínas integrais de membrana con sete hélices transmembrana, a última das cales contén o lugar de unión (unha lisina conservada) para o retinal.

As proteínas deste tipo de halobacterias inclúen a bacteriorrodopsina e a arquerrodopsina, que son bombas de protóns impulsadas pola luz, a halorrodopsina, que é unha bomba de cloruros impulsada pola luz, e a rodopsina sensorial, que media nas respostas de fotoatracción (cara á luz vermella) e fotofobia (cara á luz ultravioleta). Noutras arqueas, bacterias e mesmo en eucariotas atópase a proteína desta familia proteorrodopsina.

Notas

↑ Oesterhelt D, Tittor J (1989). "Two pumps, one principle: light-driven ion transport in halobacteria". Trends Biochem. Sci. 14 (2): 57–61. PMID 2468194. doi:10.1016/0968-0004(89)90044-3.
↑ Lottspeich F, Oesterhelt D, Blanck A, Ferrando E, Schegk ES (1989). "Primary structure of sensory rhodopsin I, a prokaryotic photoreceptor". EMBO J. 8 (13): 3963–3971. PMC 401571. PMID 2591367.

Este artigo incorpora texto en dominio público de Pfam e InterPro IPR001425.